Enzim, büyük çoğunluğu protein yapısında olan ya da protein kısım bulunduran, doğal şekilde yalnız canlılar tarafından sentezlenebilen biyolojik katalizörlerdir. Enzimlerin en önemli görevlerinden biri biyolojik reaksiyonlarda yer alarak tepkimenin hızını etkilemeleridir. Bunun yanında canlı organizmaların yoğun enerji tüketmelerinin de önüne geçer. Çeşitli etkenlerle azalan toprak mikroorganizmaları ve bu organizmaların salgıladığı hormon ve enzimler azalır. Buna bağlı olarak toprak verimliliğindeki etkinlik düşer. Enzim bitkilerin kullandığı makro ve mikro besin elementleri mikromoleküllere dönüştürerek bitki tarafından alınmasını kolaylaştırır.
Mikroorganizma veya organik madde içeren gübrelerde enzim bu canlı ortamın doğasından dolayı zaten bulunmaktadır. Ancak çoğu kez ya yeterli seviyede olmaz ya da var olan enzimin aktivasyonu için yeterli veya uygun substrat bulunmaz. Böyle olunca mikroorganizmalar biyolojik reaksiyonlarını gerçekleştirmede daha çok enerji harcarlar. Bir organik gübrenin içine doğal, steril koşullarda elde edilmiş enzim ilavesi ile mikroorganizmaların harcadıkları enerji düşer ve daha uzun süreli çalışmalarını sürdürürler.